طراحی پرایمر با نرم‌افزارهای بیوانفورماتیک (قسمت چهارم)

ساینس فریکس
ساینس فریکس
1 هزار بار بازدید - 3 سال پیش - در این دوره آموزشی با
در این دوره آموزشی با واکنش زنجیره پلیمراز یاPCR که تکنیکی در زیست‌شناسی مولکولی است آشنا می‌شوید. پلیمراز به منظور تکثیر یک نسخه منفرد یا نسخه‌های کمی از یک قطعه DNA با توالی خاص به تعداد هزار یا میلیون‌ها نسخه به کار می‌رود. پرایمر رشته کوتاهی از RNA یا DNA است که معمولا از ۱۸ تا ۲۲ باز تشکیل شده‌است. این رشته کوتاه به عنوان نقطه‌ای برای آغاز سنتز DNA عمل می‌کند. پرایمر جزئی ضروری در فرایند رونویسی DNA محسوب شده چرا که آنزیم‌های کاتالیز‌کننده این فرآیند (DNA polymeraseها) تنها قادر هستند نوکلئوتیدها را به یک رشته موجود از جنس DNA اضافه کنند. پلیمراز رونویسی را از انتهای ۳ پرایمر آغاز کرده و شروع به کپی‌کردن رشته مقابل می‌کند. پرایمرها جزئی اساسی از واکنش زنجیره پلیمراز بوده و طراحی پرایمر صحیح برای درست انجام شدن یک واکنش PCR بسیار ضروری است. حاصل دوره یافتن توالی DNA مورد نظر در بانک‌های اطلاعاتی؛ طراحی پرایمر با نرم‌افزار Gene Runner؛ طراحی پرایمر با نرم‌افزار Oligo 7؛ آشنایی مقدماتی با NCBI؛ آموزش کامل BLAST؛ ارزیابی کیفیت پرایمرهای طراحی شده با بهره گرفتن از Primer Blast.
3 سال پیش در تاریخ 1400/09/12 منتشر شده است.
1,076 بـار بازدید شده
... بیشتر